產(chǎn)品介紹

     基于隨機(jī)引物的策略方法，可以實(shí)現(xiàn)全樣本類型、全物種、全長(zhǎng)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組研究，并且大幅度提高了單細(xì)胞測(cè)序的基因檢出數(shù)，將極大拓寬單細(xì)胞技術(shù)的應(yīng)用領(lǐng)域。

產(chǎn)品特點(diǎn)

    可在單細(xì)胞水平準(zhǔn)確鑒定基因的可變剪接、可變多聚腺苷酸化（alternative polyadenylation, APA）、融合基因、基因家族和非編碼RNA等信息。

實(shí)驗(yàn)方法

     通過(guò)高通量的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組試劑盒、單細(xì)胞制備儀、分析軟件組成的完整平臺(tái)，可實(shí)現(xiàn)對(duì)每個(gè)樣本1000-20000個(gè)細(xì)胞進(jìn)行全長(zhǎng)無(wú)偏差的轉(zhuǎn)錄組檢測(cè)，并進(jìn)行mRNA、非編碼RNA等研究。使用阻斷引物與裸露的單鏈DNA結(jié)合，通過(guò)多次退火和延伸進(jìn)行原位阻斷。然后，隨機(jī)引物和oligo（dT）引物進(jìn)入細(xì)胞核與RNA結(jié)合，對(duì)全轉(zhuǎn)錄組的RNA分子進(jìn)行原位逆轉(zhuǎn)錄。通過(guò)末端轉(zhuǎn)移酶（TdT）將 Poly（dA）原位添加到cDNA的3’末端。之后，基于單細(xì)胞平臺(tái)進(jìn)行高通量單細(xì)胞核標(biāo)記。最后，進(jìn)行純化、cDNA擴(kuò)增、文庫(kù)構(gòu)建以及測(cè)序分析。

分析內(nèi)容

      細(xì)胞鑒定及基因表達(dá)定量、細(xì)胞亞群分析、APA分析、轉(zhuǎn)錄本融合發(fā)現(xiàn)、特征基因注釋、特征基因功能富集分析、蛋白調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析、轉(zhuǎn)錄因子分析、細(xì)胞周期分析、擬時(shí)序分析、RNA速度分析、細(xì)胞通訊分析、GSEA分析、腫瘤拷貝數(shù)變異分析、加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析。

分析結(jié)果示例圖