實驗項目
Label free蛋白質(zhì)組
實驗介紹：
Label free是一種不依賴于同位素標(biāo)記的非標(biāo)記蛋白組定量技術(shù)，通過液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對蛋白質(zhì)酶解肽段進行質(zhì)譜分析，無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標(biāo)簽做內(nèi)標(biāo)，只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質(zhì)時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)，比較不同樣品中相應(yīng)肽段的信號強度，從而對肽段對應(yīng)的蛋白質(zhì)進行相對定量。
實驗流程：
應(yīng)用方向：
生物領(lǐng)域各個研究方面，如：
1.農(nóng)林領(lǐng)域：抗逆脅迫機制，生長發(fā)育機制，育種保護研究等
2.畜牧業(yè)：肉類及乳品質(zhì)研究，致病機理研究等
3.基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床診斷：生物標(biāo)志物，疾病機理機制，疾病分型，個性化治療等
4.生物醫(yī)藥：藥物作用機理，藥效評價，藥物開發(fā)等
5.微生物領(lǐng)域：致病機理，耐藥機制，病原體-宿主相互作用研究等
6.海洋水產(chǎn)：漁業(yè)資源，海水養(yǎng)殖，漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等
7.生物能源、環(huán)境科學(xué)領(lǐng)域：發(fā)酵過程優(yōu)化，生物燃料生產(chǎn)，環(huán)境危定風(fēng)險評估研究等
8.食品營養(yǎng)：食品儲藏及加工條件優(yōu)化，食品組分及品質(zhì)鑒定，功能性食品開發(fā)，食品安全監(jiān)檢測等
數(shù)據(jù)分析
標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)分析內(nèi)容 | |
蛋白質(zhì)總鑒定數(shù)量分析 | 蛋定與定量結(jié)果統(tǒng)計、差異結(jié)果統(tǒng)計、火山圖、聚類熱圖 |
差異蛋白質(zhì)功能分析 | 亞細胞定位、結(jié)構(gòu)域分析、GO功能分析、KEGG通路分析、PPT互作網(wǎng)絡(luò)分析 |
質(zhì)量控制分析 | 肽段離子質(zhì)量偏差分布、肽段離子得分分布、蛋白質(zhì)豐度比分布 |
高級數(shù)據(jù)分析內(nèi)容 | |
WGCNA共表達分析 | 獲得與表型強關(guān)聯(lián)的核心蛋白質(zhì) |
趨勢聚類分析 | 探討蛋白質(zhì)的表達趨勢模式 |
技術(shù)優(yōu)勢
? 無需昂貴的同位素標(biāo)記試劑，實驗周期短
? 可用于不同物種間的“有無差異蛋白”比較
? 克服標(biāo)記定量技術(shù)在樣本數(shù)量的上限制，靈活方便